农业部新兽药工程重点实验室在中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所药物研究室的基础上成立，由我国著名兽医学家盛彤笙教授与1959年创建，是我国最早开展兽药研究的唯一国家级专业机构。主要从事兽用化学药物的设计、合成及筛选；天然药物有效成分的提取、分离、鉴定与合成；生物药物、抗生素筛选与制备；兽药基础理论研究与新兽药制剂开发；兽医药理学、毒理学、兽药残留与安全评价研究。创制出我国仅有的4个拥有自主知识产权的国家一类新兽药中的3个（静松灵、痢菌净、喹稀酮）；承担国家、省部等各级科研项目200余项；申报国家发明专利10余项；取得国家科技奖励3项，省部级奖励16项；其他奖励17项；发表科技论文1200余篇；培养研究生79名；研制成功并已投入生产的药物主要有19种，是国内兽药研发能力最强的机构。重点实验室下设三个研究方向：兽用化学药物、天然药物和生物药物。研究用房1000m²，标准化动物实验用房576m²，GMP药物中试车间1300m²。